Forniamo i batteri Rhodopsin, bacteriopsin di Bacteriorhodopsin della proteina della membrana, HsBR.

La nostra proteina senza cellula è stata funzione verificated.

Introduzione

Bacteriorhodopsin (BR) è una proteina di 7 transmembrane che funge da da pompa guidata da luminosa del protone nel archaebacteria. dovuto il suo legante colorato in covalenza limitato, BR è ampiamente usato come proteina della membrana di controllo, per esempio per le analisi di cristallizzazione ed esperimenti biochimici/biofisici.

Struttura

Bacteriorhodopsin è una proteina integrale della membrana trovata solitamente in toppe cristalline bidimensionali conosciute come «la membrana porpora», che può occupare fino a quasi 50% dell'area della cellula archaeal. L'elemento di ripetizione della grata esagonale è composto di tre catene identiche della proteina, ciascuna rotanti da 120 gradi riguardante le altre. Ogni catena ha sette alfa eliche del transmembrane e contiene una molecola del retinalburied di in profondità dentro, la struttura tipica per le proteine del retinylidene.

Funzione

Bacteriorhodopsin appartiene ai rhodopsins microbici. Hanno similarità ai rhodopsins vertebrati, i pigmenti quella luce di senso nella retina. Rhodopsins inoltre contiene retinico; tuttavia, le funzioni del rhodopsin e del bacteriorhodopsin sono differenti e c'è similarità limitata nelle loro sequenze aminoacidiche. Sia il rhodopsin che il bacteriorhodopsin appartengono alla famiglia del ricevitore 7TM delle proteine, ma il rhodopsin è un ricevitore proteina-accoppiato G e il bacteriorhodopsin non è.

La molecola di bacteriorhodopsin è porpora ed è più efficiente a luce verde assorbente (lunghezza d'onda 500-650 nanometro, con il massimo di assorbimento a 568 nanometro). Bacteriorhodopsin ha un vasto spettro di eccitazione. Per una lunghezza d'onda di rilevazione fra 700 e 800 nanometro, ha un'emissione individuata apprezzabile per le lunghezze d'onda di eccitazione fra 470 nanometro e 650 nanometro (con un picco a 570 nanometro). Una volta pompato a 633 nanometro, lo spettro di emissione ha intensità apprezzabile fra 650 nanometro e 850 nanometro.

Trasferimenti di protone principali nel photocycle di bacteriorhodopsin. I gruppi di Protonatable e le molecole dell'acqua legata importanti per attività di trasporto sono indicati come la rappresentazione del bastone e sfere blu, rispettivamente (identificazione di PDB: 1C3W). I numeri con le frecce rappresentano la sequenza delle reazioni di trasferimento di protone, le transizioni corrispondenti fra i photointermediates sono indicati nell'inserzione. Le eliche del TM sono indicate nei seguenti colori: A, blu; B, alzavola; C, verde; D, verde di calce; E, giallo; F, arancio; G, rosso; ed il cromoforo è descritto come bastoni neri. Trasferimento di Proton del ① dal RSBH ⁺ nel accettore primario Asp85 del protone; rilascio del protone del ② al medium extracellulare dal complesso diliberazione; reprotonation del ③ del RSB dal donatore primario Asp96 del protone; reprotonation del ④ di Asp96 dal medium citoplasmico; trasferimento di protone del ⑤ da Asp85 nel complesso diliberazione.

Le informazioni di cui sopra sono una citazione da Rev. 2014 l'8 gennaio di Chem; 114(1): 126-163. 23 dicembre online pubblicato 2013. doi: 10.1021/cr4003769

Specificazione