Sintesi oligo di controllo degli iniettori del DNA di sintesi oligo degenerata proporzionale dello stagno

Sintesi oligo del DNA degli iniettori di sintesi oligo degenerata su ordinazione degenerata dello stagno

I oligos del DNA chimicamente sono sintetizzati con quattro deossiribonucleotidi di A, di T, della C e del G. Queste sequenze sono ampiamente usate in vari modi nel campo di biologia. SENZA CELLULA è sicuro nella nostra capacità di fornire i prodotti oligo di alta qualità del DNA ai ricercatori scientifici ed ai clienti industriali intorno al mondo. Con la combinazione di nostri sintetizzatore avanzato, tecnologia di produzione avanzata e gruppo professionale del supporto tecnico abbiamo raggiunto coerente i tassi bassi di mutazione, i brevi tempi di ritorno, l'alta prestazione di costo.

I codici genetici hanno la tendenza a degenerare, che conducono all'uso degli iniettori degenerati negli esperimenti di PCR ai geni specifici della mostra. SENZA CELLULA fornisce sia la progettazione che la sintesi di questi iniettori degenerati come pure la sintesi oligo degenerata su ordinazione dello stagno su richiesta.

Introduzione

Un iniettore degenerato è definito come: «Una miscela delle sequenze dell'oligonucleotide in cui alcune posizioni contengono una serie di basi possibili, dante una popolazione degli iniettori con le simili sequenze che riguardano tutte le combinazioni possibili del nucleotide per una sequenza data della proteina» (Iserte 2013). Per esempio:

ATC DI ATCGTT [GASCROMATOGRAFIA] AAGT [AGC]

si riferisce ad una serie di iniettori in cui il settimo ed i dodicesimi nucleotidi sono degenerati. La quantità di degenerazione è definita dal numero delle combinazioni differenti dell'iniettore nella miscela. L'esempio di cui sopra ha un valore della degenerazione di sei.

Assista la lista

• Servizio standard: Nessuna tassa di progettazione, adatta a progetti di PCR più di di 95%.
• Servizio superiore: Utilizzato per determinati progetti sensibili a polarizzazione di codone. SENZA CELLULA può ridurre significativamente la deviazione inerente alle procedure di sintesi e realizzare il controllo proporzionale accurato.

* la proporzione bassa non standard dovrebbe essere dichiarata chiaramente, per esempio, N (20%A: 30%C: 40%G: 10%T).

Progettazione degli iniettori degenerati

1) Allini le sequenze aminoacidiche multiple facendo uso di software online libero.
2) mira ad un'area circa 200-500 coppie di basi di lunghezza per l'amplificazione ottimale di PCR.
3) posiziona gli iniettori di andata ed inversi in più regioni conservate – meno il degenerato, ulteriore il diverso questi può essere.
4) include fra 6 e 7 aminoacidi negli iniettori, uguaglianti a ~15-20 coppie di basi.
5) prova ad includere la metionina ed il triptofano di aminoacidi, che sono codificati da un singolo codone (codice di tre lettere del nucleotide) ed ad evitare la leucina di aminoacidi, la serina e l'arginina, che possono ciascuno essere codificate tramite sei combinazioni di codone.
6) per le procedure di clonazione successive ed alla lunghezza dell'iniettore di aumento (e quindi alla temperatura di ricottura) aggiunga un 5' coda (6-9 coppie di basi) che contiene un sito degli enzimi della restrizione.
7) se c'è la degenerazione completa (nessun partite fra qualsiasi specie date), studi la possibilità di usando l'inosina bassa (strutturalmente simile a guanina) poichè può accoppiare con c'è ne delle quattro basi, sebbene leghi preferenziale a citosina. Alternativamente, l'inserzione N affinchè qualsiasi base assicuri le concentrazioni equimolari di ogni base a quella posizione in vostro iniettore si mescola.
8) evita la degenerazione al 3' estremità (questo non sarebbe un buon posto per inserire l'inosina).